Японский подвид обыкновенной выдры является одним из многих животных Японии, вымерших в ХХ веке.
Будучи некогда довольно обычной, она полностью исчезла по причине прямого уничтожения ради меха и сокращения площади пригодных для обитания природных территорий.
Последний раз её видели на острове Сикоку в 1979 году, официально признана вымершей 28 августа 2012 года.